五千年前，為禍世間的天邪神在被鎮壓后，化為九只邪眼，潛伏于大千世界，等待著復活的時機。五千年后，九只邪眼陸續現世。據說這世間只有一少年才可以拯救世界，成為諸神的守護，這位被稱為大主宰的少年叫牧塵(王源 飾)，是牧城的少主，他因為靈脈被封，沒有靈力而備受白眼。

牧塵的父親——牧城的城主牧峰將牧塵送到北靈院學習，而牧塵因為沒有靈力總是被同學欺負。沒有靈力就意味著無法驅動靈陣，如同一個廢人。牧塵備受打擊，跑到郊外痛哭發泄，牧峰安慰兒子，他在靈陣上的天賦無人能及。牧塵卻感到很無奈，靈陣的天賦再高，沒有靈力，就如同紙上談兵，只能畫靈陣，卻無法驅使它。牧峰勸牧塵去參加五大院的考核，在父親的一再安慰下，牧塵終于重新拾起信心，跟著父親回家。

龍淵譚由幾大家族輪流守護，轉眼一屆將滿，牧峰將趕往龍淵譚，他唯一放心不下的就是牧塵，臨行前托北靈院的院長莫師照顧牧塵。

北靈少年志之大主宰海報

牧塵在父親的勸說下，回到北靈院。牧塵有個非常要好的朋友叫譚青山(徐浩 飾)，兩人既是同桌，又住在同一間寢室，感情非常好。平時總喜歡打打鬧鬧，逃課出去玩。這次也不例外，他們又逃課出去逛街，卻遇到了柳城的柳陽，柳陽一向仗勢欺人，他看不起沒有靈力的牧塵，愛欺負沒有后臺的譚青山。柳陽欺負譚青山，牧塵出手教訓他，但因為沒有靈力落了下風。這時唐城的少主唐芊兒(王奕婷 飾)出手相助，斥責了柳陽。唐芊兒和柳陽的大哥柳城的少主柳慕白(駱明劼 飾)有婚約，柳陽故意當著眾人的面稱呼唐芊兒嫂子，令唐芊兒很難堪。最終柳陽和牧塵的爭斗由莫師出面制止了。

莫師接到老友洛神族洛天河的來信，洛神族受到血神族的迫害，他將自己的孫女洛神族神女洛璃(歐陽娜娜 飾)托付給莫師。

血神族血靈子的手下血弒帶著一幫人追殺洛璃，洛璃在守衛的保護下逃脫，但是守衛卻被血靈子殺害。洛璃逃到北靈院附近的小河邊，正好遇到了牧塵在布靈縛陣。牧塵第一次布下靈縛陣，但是因為他自己沒有靈力，無法親身體驗陣法的威力，誰知洛璃卻誤打誤撞走進陣法里。洛璃誤以為牧塵是血神族派來追殺她的人。牧塵連忙解釋誤會，但是因為他是初次布陣，自己也無法解開陣法。洛璃一怒之下用靈力強行毀掉陣法，牧塵被靈力的威力震暈。而洛璃的行動也驚動了血弒，洛璃巧妙避開了血弒的追捕。

洛璃來到北靈院見到莫師，莫師得知她來北靈院避難的目的就是為了尋找靈獸九幽(馬月 飾)雀，召喚河神之力，振新洛神族。雖然洛璃的靈力已經達到了神魄境界，但是憑她現在的靈力還是無法降伏九幽雀，莫師不免替她擔心，洛離卻告訴他洛天河將能夠降伏九幽雀的芥子幣交給了她。這時洛離才發現自己隨身攜帶的芥子幣丟失了，洛璃最后一次接觸過的人只有牧塵，她懷疑牧塵偷走芥子幣。

牧塵醒來后發現洛離已經不見了，他在河邊的亂石堆里踩到了芥子幣，不過他并沒有在意，而是回了北靈院。

牧塵在和譚青山、唐芊兒聊天時突然想起了洛璃，正巧洛離提著劍怒氣沖沖地來到牧塵面前。洛璃二話不說就拔劍指向牧塵，逼他交出芥子幣，牧塵感到莫名其妙，無論他如何解釋洛璃還是一口認定他偷走了芥子幣。洛離正要用武力逼牧塵，這時柳慕白及時攔下了她。柳慕白替牧塵擔保，他絕不會偷芥子幣。

牧塵半夜睡不著覺，想起白天在河邊踩到的金屬片也許就是洛璃想找的芥子幣。牧塵借著月色去找芥子幣，卻眼睜睜地看著它被北冥金紋鷹叼走，

洛璃半夜潛入牧塵的房間，并點住了譚青山的穴位，開始翻箱倒柜地搜尋芥子幣。牧塵回到宿舍，告訴洛璃芥子幣被鷹叼走了，洛璃根本不信。

洛璃一直盯著牧塵，上課時都坐到他身邊。北靈院為了讓學員們順利參加五大院的考核，準備給大家進行一次模擬考核。考核要求是組隊進行，牧塵和譚青山毫無疑問是一組，洛璃主動要求和牧塵組隊，牧塵卻提出條件，要跟著柳慕白。這次的考核要求是兩人組隊，帶著玉瓶進入秘境擊殺靈獸，將靈獸的靈力收入玉瓶內。

學院的老師魔師給大家上靈陣課，他讓洛璃起來回答問題，牧塵巧妙提示洛璃，幫她解圍。在課堂上，牧塵因為擅自改變陣法差點釀成大禍。

龍宮，龍族守護人黑龍至尊因為無法復活龍蛋而傷透了腦筋。