亞歷克斯給夢游者號援助艦隊發了無線電，他們將進行一些小小的制動操作，讓夢游者號有足夠的空氣離開。奈奧爾聽到亞歷克斯的這一重大舉措，忍不住夸亞歷克斯做得好，更感謝他救了那么多人。在亞歷克斯匯報了夢游者號的事情之后，奈奧爾詢問亞歷克斯，有關羅西南多號的情況，亞歷克斯遺憾地告訴奈奧爾，魚雷的很多殘片都擊中了下層艙體，船尾還有很多破損，讓奈奧爾跟他一起修理一下。就在亞歷克斯跟奈奧爾說明羅西南多號的問題之時，無意間發現他們想要殺死的那個原分子病毒就在羅西南多號的倉庫里，而它很可能是在亞歷克斯他們之前逼它入溫室穹頂之時，跑到了他們的倉庫之內。雖然不知道那個原分子病毒如何活了過來，但霍頓認為他們現在的唯一目的就是將它殺死，并為此不惜一切代價。霍頓和艾莫斯前往倉庫，找尋那個原分子病毒，而此時原分子病毒正往自己的胸口拔掉它的一個裝置，霍頓只好命令艾莫斯跟他一起向原分子病毒開火。火拼了一陣之后，那個原分子病毒用一個貨柜把霍頓釘在了墻上，而艾莫斯卻沒辦法打開磁力鎖。就在艾莫斯試圖打開磁力鎖之時，霍頓發現艾莫斯的面罩在漏氣，他只得命令艾莫斯離開倉庫。艾莫斯走后，那個原分子病毒突然覺得霍頓不構成威脅，所以沒有再向霍頓靠近。孟博士查到，那個原分子病毒從自己胸口拿走的是自毀裝置，是某種指令控制裝置，所以他認為那個原分子病毒也并非愚蠢的生物。亞歷克斯認為孟博士是馬后炮，忍不住跟他吵了起來，奈奧爾只得勒令他們停止爭吵先把那個原分子病毒趕走再說。就在爭吵的同時，原分子病毒拼命地砸艙門，奈奧爾這才明白過來，原分子病毒是靠輻射生存的，而它正想去反應堆。奈奧爾他們在原分子病毒砸艙門之時，討論辦法除掉原分子病毒，亞歷克斯想要高速旋轉把原分子病毒跌出他們的飛船，可奈奧爾不答應，因為這樣做了霍頓會被撕成兩半。孟博士認為原分子病毒以前是個人，就一定會局限性，所以他建議電擊它，可亞歷克斯卻認為原分子病毒連子彈都不怕，電擊根本對它起不了作用。艾莫斯講了他之前做學徒的一個故事，想用氣壓炸開原分子病毒，可奈奧爾還是因為霍頓在倉庫里，而堅持不肯按照艾莫斯的方法做。原分子病毒挖得很快，幾乎已經把艙門的一層夾板給掀掉了，亞歷克斯這才想到關閉引擎拖延時間。關閉引擎之后，原分子病毒果真不挖艙門了，可它卻回頭去找霍頓，逼得亞歷克斯只得再開引擎。就在大家為救霍頓的事情犯難之時，孟博士通過他植物學的養分梯度想到了辦法，認為他們可以找一個魚雷的核彈頭，把原分子病毒誘騙出去。奈奧爾和孟博士帶著魚雷走出船艙，等他們拿出核彈頭之時，原分子病毒果真被他們引誘了出來，而孟博士卻差點把原分子病毒當成孟梅，遲遲不肯扔核彈頭，到原分子病毒非常靠近他們之時，他才在奈奧爾的催促下，扔掉了核彈頭，把原分子病毒摔落太空，亞歷克斯再趁機銷毀原分子病毒，化解了羅西南多號的危機。在霍頓得救后，奈奧爾向霍頓坦白，她并沒有銷毀原分子病毒樣本，而是把它交給了佛瑞德。（本季終）