被帝國星人雷奧尼克斯打敗并毀掉格斗儀的美菲拉斯星人雷奧尼克斯無助地漂泊著，突然發現了一把插于地上的純黑色的劍，拔劍，穿上鎧甲，他變成了暗黑美菲拉斯。另一方面，在初次見到鏢形物體的時候已經疑心的隱岐終于確認那是賽文奧特曼的頭鏢，這一結果震驚了眾人。此時，頭鏢發出光芒呼喚雷。順著呼喚的指引，盤龍號進發的途中遇到了暗黑美菲拉斯并被擊落。