2014年夏天，大西洋西非的某個海域，巡羅的警察發現有一艘可疑的船只停在海中央，于是下船去檢查。上了船之后，警察才發現，這是一艘幽靈船只，船上的人都已經死了很久，他們只得放火燒船，馬上撤離這艘船只。中國病毒學家鄭書鵬(羅晉 飾)，是第十九批到達卡巴利亞首都費爾雷恩，援助卡巴利亞的醫療隊副隊長，他在這里生活了兩年，即將回國。2014年7月，鄭書鵬和戰友檢驗科的謝云虎(劉天佐 飾)，在中國-卡馬利亞友好醫院做著各種離別前前的告別，開心地等待著回國的日子。鄭書鵬在跟大家告別之際，最放心不下的便是中卡友好醫院外科的蓋斯姆(山姆 飾)卡馬拉，因為蓋斯姆卡馬拉是在卡巴利亞最好的朋友，可蓋斯姆卡馬拉卻一直不聽他的勸告，常常忘記一個醫生該做的防護，沒有按照嚴格的接診規則替病人看病，讓他很擔心蓋斯姆卡馬拉會在某一天不小心被病毒感染。鄭書鵬去給蓋斯姆卡馬拉送口罩和酒精消毒液時，發現蓋斯姆卡馬拉又跟病人擁抱，忍不住又去嘮叨他。謝云虎著急地把鄭書鵬叫走，因為他們要去買東西為茜茜過生日，他不想耽誤時間讓茜茜哭鼻子。謝云虎覺得，他們和蓋斯姆相處了兩年，了解蓋斯姆的脾氣，就不要多言了，可鄭書鵬就是不放心。蓋斯姆是一個在中國留學多年，即將升任中卡友好醫院外科主任的外科醫生，他喜歡中國美食和中國音樂，對《梁祝》尤其喜歡，還買了一盤磁帶珍藏起來。鄭書鵬和蓋斯姆相處很愉快，在他即將回國，一切歸于平靜之際，一個突如其來的病人，打破了這所有的一切，也讓鄭書鵬歸國的計劃泡湯了。2014年7月18日，中卡醫院來了一個特別的病人，蓋斯姆初步檢查以為他只是得了瘧疾，所以按這個方法去處理，可沒想到注射之后18床病人不僅沒有好轉，還開始流血了。鄭書鵬和謝云虎兩人去街上采買，跟熟識的卡馬利亞居民告別后，準備回家準備生日的事情時，接到了醫院的電話，得知醫院收了一個可能是四級病毒的病人。鄭書鵬急著趕回醫院的路上，給燕都省人民醫院感染科的主任馮剛(許亞軍 飾)打了電話，將這位特殊的18床病人的情況，跟馮剛做匯報。鄭書鵬匯報完，發現前方的路堵了，他只能下車一路跑回醫院，可還是遲了一步，因為他回到醫院時病人已經流血不止不治身亡了。鄭書鵬擔心18床病人帶來的是四級病毒，他急需要卡巴利亞唯一一個可以檢測四級病毒的實驗室斯賓塞生物安全四級實驗室檢測，以確定院內是否被感染，所以他帶著謝云虎去了一趟斯賓塞。四級病毒的危害性和致死率最高，需要在生物安全四級實驗室內進行操作，才能確保實驗員的安全。生物安全四級實驗室采用定向負壓系統，實驗員需穿著完全密封獨立供氧氣的正壓防護服，進入核心區，因為這身衣服是實驗員和高危病毒之間的唯一防線。在非洲，人類和野生動物距離過近，許多危險病毒都在此肆虐，瘧疾、黃熱病、拉沙熱，還有我們最害怕的一種病毒埃博拉病毒。1976年，埃博拉病毒第一次出現，就在扎伊爾地區感染了三百一十八人，造成二百八十人死亡，它沒有疫苗也沒有藥物可治療，死亡率高達百分之五十到百分之九十，號稱“生命黑板擦”。鄭書鵬擔心十八床病人感染的便是埃博拉病毒，他才急于檢測該病人的血以確定真假，因為萬一他的猜想成真，按照卡巴利亞的生活習慣，眼下肯定很多人已經被感染了，而這對于醫療匱乏的卡巴利亞來說，是一場災難。泛非通訊組織《全球視界》記者何歡(毛曉彤 飾)，去聯合國難民營采訪，因為同情他們的遭遇，她想在去卡巴利亞前，為那些難民買一些新衣服再出發。鄭書鵬的檢測有了結果，十八床病人感染的正是埃博拉病毒，所以卡巴利亞衛生部門馬上將中卡友好醫院進行封鎖消毒，并將密切接觸者隔離觀察。在被隔離之時，密切接觸者中國援卡醫院王雯茜在駐地隔離，而今天偏偏是她的生日，讓醫療隊好不容易布置的氣氛，一下子被籠罩在烏云之中。王雯茜看著埃博拉病毒的相關信息，發現死亡率高達百分之九十，把她嚇住了，放聲在隔離室里哭了起來。與此同時，中國駐卡醫療隊也無心這個生日宴，都害怕萬一被感染，就要客死異鄉了。