齊懷正(成泰燊 飾)帶隊剿匪大獲全勝林凡清(林江國 飾)緊急應對羊群疫情

齊懷正趕到總場，提出要帶隊去剿滅土匪，李國祥(周惠林 飾)堅決不同意。兵團主要任務就是搞生產建設，剿匪是公安隊的工作。齊懷正擔心離自己百多公里的公安隊無法有效保護牧場的安全，尤其是試驗站的安全，李國祥答應去師部幫他請示，但是也警告齊懷正不許擅自行動。

齊懷正把李團長的意思告訴了巴圖爾(阿力木江·吐爾斯別克 飾)，本來摩拳擦掌的大家都倍感失落。齊懷正思前想后還是決定自己帶隊去剿匪，還要徹底消滅他們，為實驗站掃除這個安全隱患。他讓巴圖爾放出風去，周三除了值班人員，全體員工去總場體檢。

土匪很快得到了消息，計劃趁機偷襲牧場。齊懷正派兩名戰士去試驗站保護林凡清和羊群，其他人都和他埋伏好，準備將土匪一網打盡。

總場這邊，李國祥批準了周慧和靜芝去沙門子做體檢，許靜芝(徐百卉 飾)和周慧走到半路，遭遇了正趕去牧場的土匪襲擊，隨行的戰士一邊還擊一邊掩護她們撤退，眼看一個戰士受傷，另一個子彈打光了，大家陷入了絕境。埋伏在附近的齊懷正聽到槍聲，立刻帶隊趕過來，打退了土匪，救了許靜芝和周慧他們。齊懷正讓巴圖爾帶隊追擊土匪，自己留下來一邊埋怨周慧冒冒失失趕來差點出事，一邊安排人先把他們送回總場，等自己這里情況穩定了再說體檢的事。

隨后，齊懷正帶隊和巴圖爾匯合，他們悄悄潛到土匪的老窩，打了土匪一個措手不及。齊懷正下令乘勝追擊，而一直盯著匪首的齊懷正發現逃跑的土匪里并沒有匪首的身影，他悄悄潛入匪窩，一舉擒獲了躲在這里妄圖逃跑的土匪頭子。此次剿匪戰役大獲全勝，所有土匪死的死被抓的被抓。

李國祥把齊懷正叫來興師問罪。齊懷正苦著臉想功過相抵，被李國祥狠狠教訓，又獎勵了他一頓酒，齊懷正這才放下心來。

齊懷正回到農場，正和林凡清商議種羊推廣的事宜，巴圖爾樂呵呵的告訴他們，自己的羊學會了新把戲，比著賽在轉圈圈。林凡清聽了卻大驚失色，他趕過去查看，發現這兩只羊很可能得了羊腦包蟲病，一種致命的烈性傳染病。林凡清讓大家把這兩只羊隔離，然后把羊群分成小群，以防互相傳染，又趕著寫了一封信，讓齊懷正拿去總場找獸醫童老師來幫忙。老齊見林凡清如臨大敵的樣子，也很是緊張，把自己不在期間的領導大權全權交給了林凡清，還把自己的馬鞭給了他，誰敢不聽命令就揍他。

林凡清和鄭君(張瀟恒 飾)分工，爭取在兩天里找到下面居無定所的幾個畜牧小隊，檢查羊群的情況。正安排著，吳小豆來匯報，那兩只隔離的羊死了。林凡清讓大家把羊埋掉，楊月亮(馬境 飾)很是心疼，不想浪費，她覺得燉熟了就沒有關系了，林凡清不理楊月亮，還是讓人強行把羊埋掉了。

楊月亮一邊做飯一邊罵林凡清，林凡清處理完了病死羊，也帶著邵紅柳(邢珊 飾)來找楊月亮算賬。他嚴肅地給楊月亮講了羊腦包蟲病的嚴重性和對整個羊群甚至整個牧區的危害，楊月亮這才意識到問題的嚴重性。就在這時，吳小豆和鄭君來向林凡清匯報，巴圖爾帶著牧場直屬隊的羊群跑了。林凡清生怕帶病的羊又造成更大范圍的傳染，立刻帶人去追。林凡清總算追上了巴圖爾，勸他把羊群趕回去進行隔離，巴圖爾卻認為林凡清一個大學生，都沒養過羊，輕易的就要把自己的羊埋掉，堅決不回去，還把擋路的林凡清捆起來和馬拴在一起，自己揚長而去。林凡清被綁著牽著馬往會和地點走，終于碰上了來支援的紅柳，鄭君和楊月亮，大家都對倔強的巴圖爾沒辦法。

第二天一早，齊懷正帶回來獸醫童大夫，聽吳小豆講述巴圖爾帶羊逃走的事，他很生氣，抓回了巴圖爾一頓狠批。齊懷正明確表示林凡清和大家是兄弟，他就是為了避免更大的損失才要把羊隔離的，齊懷正命令巴圖爾向林凡清賠禮道歉，而林凡清更擔心和巴圖爾的羊共用草場的試驗站的種羊。

童大夫仔細檢查了羊群的疫情，證實了林凡清的判斷，但是針對這種病只能灌藥給健康的羊做預防，對已經染病的羊還沒有特效藥，雖然聽說國外有手術治療的情況，但也只限于研究方向，對于牧區成千上萬的羊群并沒有實際操作的意義。林凡清和童大夫寫了一份書面材料，讓齊懷正派人送到總場，請團長連夜向師部匯報，不但沙門子，附近的兩個縣都有疫情的危險。師長接到材料，立刻會同塔北專員江一濤召開緊急會議，派人通知和統計各場區的疫情情況。

齊懷正把羊群的管理工作都交給了林凡清，而面對已經得病的，和有患病風險的幾只甚至幾十只羊，林凡清和童大夫商量過后的結果，只有一個處理辦法，就是活埋。齊懷正心痛這巨大的損失，他希望林凡清能做點什么，救救這些得病的羊而不是看著他們死去。林凡清深感自己的無力，只能向老齊申請，全力以赴保護試驗站的種羊。齊懷正也知道實驗站的羊影響的是牧場甚至整個牧區，整個新疆的品種改良，讓林凡清無論如何保住實驗站的羊，成功了，自己為他請功。庫爾班和邵紅柳已經把試驗站的羊全部分群隔離，每十只母羊一群，種公羊單獨隔離，但是庫爾班發現那只最重要的種公羊不對勁，林凡清和童大夫懷疑它也感染了。邵紅柳急得大哭，這是她父親生前留下最好的一只種羊，如果它死了，整個實驗都得中斷，她苦苦懇求林凡清想辦法救它，林凡清也一籌莫展。齊懷正聽說了消息也趕了過來，看到林凡清碰到事情六神無主的樣子很是失望，指責他沒做好大家的主心骨，讓他打起精神來想辦法。