不動高中發(fā)生過7件不可思議的事情，那是潛伏在舊教學樓里的怪人所設下的七個詛咒，其中第一個詛咒就是打不開的生物教室，據說一天晚上，一個老師安排女學生去生物教室里換燈泡，忽然看到了一個怪人，不小心被勒死了，教室從此關閉了，成為了打不開的生物教室。第二個就是手掌爬動的打印室，一個男同學不小心將在打印室切斷了手掌，至今他的手掌都在打印室里彷徨不知歸處。第三血染之井，一個女生打掃衛(wèi)生的時候被面具人推下了井，結果導致女孩的鮮血染紅了井水。第四在二樓走廊有一個停止轉動的大鐘表，一個老式在倒轉指針的時候被壓在了鐘表下面，導致當場死亡，第五是無底泳池，只要是穿著紅色泳衣，就會被人抓住腳踝拖下水中，導致死亡，死者腳踝處還有一道紅色的印記。第六詭異的第十三級臺階，被封閉了的教室那邊，本來不應該有第十三級臺階，可是當同學數到了第十三級臺階，放學路上就發(fā)生了交通意外，至于第七個不可思議至今都內容不祥。在不動高中有個學生成員組織的推理社，社長是櫻樹學姐，其中還有七瀨美雪，和天才推理作家真壁誠、小胖和喜歡拍照的佐木龍?zhí)骷覄偮犆姥┙榻B萬七不思議就趕緊離開接受采訪去了，而櫻樹則要調查事情的真相，而那個杜撰了教學樓里的怪人，自稱是放學后的魔術師。學校要對舊學樓進行拆除翻蓋，校長接到了一封放學后的魔術師留下的恐嚇信，稱只要拆毀了那里，他就下七個詛咒，因為這個恐嚇信，學校已經好幾次都終止拆除教學樓了，但現在校長要不顧恐嚇繼續(xù)進行。此時，聽聞外面著火了，嚇得大家都忙跑過去，卻只是不讓老師省心的金田一正在焚燒一些東西。金田一的爺爺是著名的偵探，當看到美雪的七不思議推理的時候也很感興趣。晚上，當櫻樹一個人在推理社的時候，真壁誠前來騷擾，表達對櫻樹的感情，櫻樹卻只是喜歡有才華的人。真壁誠自以為是，認為自己才華橫溢，上前就抱著櫻樹，櫻樹一把推開了真壁誠，還因此撞倒了書架，櫻樹揭穿真壁誠是浪得虛名，真壁誠匆忙離開。櫻樹一個人整理書架，卻發(fā)現了重要線索，慌忙打電話給美雪，美雪比較害怕特意拉上了金田一。幾個人和保安一起，在走廊里看向對面的生物教室，竟然看到了櫻樹被吊死在里面，旁邊還有那個面具人，嚇得幾個人慌忙趕去了生物教室。但是撞開門之后發(fā)現里面空無一人，就連門鎖和窗戶都安然無恙，這讓大家非常害怕，擔心是放學后的魔術師所為。正當大家都以為這只是一個玩笑的時候，櫻樹被吊死在了舊學樓，警察也迅速展開調查，對所有接觸案子的人都進行了詢問。對于那個密室里的人是如何消失的都產生了疑惑。小胖特意找到了真壁誠，指責真壁誠殺了櫻樹，因為他親耳聽到了真壁誠和櫻樹的對話，知道真壁誠小說背后是有槍手的，真壁誠諷刺小胖沒有證據就是胡亂說，還罵他就是一個蠢貨，氣得小胖拿棍子打了真壁誠，導致真壁誠手心受傷。真壁誠氣急敗壞去找佐木龍?zhí)煿炙鲑u了自己，這讓佐木很委屈。小胖苦于找不到證據，無法揭穿真壁誠的真面目，氣急敗壞之下撕毀了所有真壁誠的海報，面具人再次出現殺了小胖。次日，學校里再次發(fā)生了學生被殺事件，警方劍持勇帶隊再次趕來，懷疑這是模仿殺人，管理員阿花提醒金田一千萬不要多管閑事，現在學校里很危險。佐木發(fā)現真壁誠的手受傷，且昨天事情敗露，因此懷疑是真壁誠殺了小胖，因此報告給了老師，真壁誠被帶去了警察局。但金田一卻不相信真壁誠殺人，因為當天喜歡錄像的佐木一直都在拍攝，而且從拍攝時間顯示金田一當時也在，根本不具備作案時間。美雪忽然想起自己的東西忘在了推理社忙跑回去拿，結果無意中發(fā)現了櫻樹留下的電腦筆記，上面清楚顯示著七組數據，應該就是七不思議的秘密，美雪剛想要告訴金田一的時候，卻被人用錘子打暈了。金田一發(fā)現不見了美雪，想起七不思議的第三個死法，趕緊和佐木趕去了井口邊，果真發(fā)現了暈倒的美雪，迅速將其送去醫(yī)院，但是由于受傷嚴重不確定什么時候醒來，這讓金田一很生氣，主動找到了劍持勇，表示一定要將案子查清楚，相信一定有人故弄玄虛。金田一讓佐木調取了當時拍攝的推理社畫面，放大了電腦上的數字，猜想美雪就是看到了這個才被殺的，為了能揭開謎底，金田一和劍持勇再次還原了現場情況，他們看見尸體吊在房間里，到從走廊奔向生物教室也只是用了50秒，這個時間內的兇手是不可能處理好尸體離開的。金田一還特意做了一個實驗，自己假扮成了面具人，還能讓人看見金田一被吊起來的樣子，嚇得眾人趕緊趕過去，結果發(fā)現什么也沒有，金田一穿著面具人的衣服出現在眾人眼前，現場弄了一個假人通過鏡子投影的方式，讓人們看到了一個假象，實際上放置尸體的房間是在生物教室對面的物理教室，兇手故意制造了一種假象，讓人覺得是受到了詛咒的密室殺人。的場老師被金田一指認殺人，的場不服氣，認為自己沒有殺人的理由，金田一卻帶著大家來到了推理社，這里才是原本第七個不思議消失的音樂教室，哪一些數字就是一個緯度數字，當年第七個音樂教室里，老師和學生自殺，但學生不想自殺，被老師反殺，教室里的血跡怎么也擦不干凈，后來因為音樂教室改成了推理社，因此也成了消失的音樂教室。金田一撕掉了墻壁上的真壁誠畫報，竟然露出了一個小洞，里面赫然放著一具頭骨，而這個人正是十年前被的場殺死的學生青山千尋。劍持勇想起了在十年前有過一場建筑工地6人被殺的事情，詢問的場是否也知道。的場見事情敗露，只好說出緣由，在來這里當老師之前，他是一個建筑隊工人。25年前，一處工地上由于人員匱乏，各方面管理都不到位，為了趕工，也沒有進行對地質勘探就施工了，結果導致瓦斯爆炸，死了6個人。公司為了隱瞞事情就將6個員工就地掩埋，也就是現在的舊樓，后來公司派遣的場來這里當老師，目的就是為了守住六個人的秘密，青山千尋就是知道了這個秘密才被的場叫到了音樂教室里，在這里殺了她，放在墻壁里。的場很自責，覺得自己對不起學生們，25年來，他也飽受這種情感折磨，阿花忽然沖出來殺了的場，要為他的女兒青山千尋報仇，他之所以來這里就是為了查找女兒死亡真相美雪也從昏迷中醒來，劍持勇來學校探望了美雪和金田一，也告知二人阿花將會被從寬處理，而的場只是昏迷，并沒有生命危險，終將接受法律制裁。此時，有人向劍持勇匯報，六具尸體已經被挖出來了，劍持勇慌忙離開。美雪看著自己和金田一小時候的合影忍不住笑了，金田一不知道她笑什么反而笑話了兩句，氣得美雪調頭就走。