機器人梅身份暴露納迪爾財團浮出書面

菲爾把《黑暗之書》給了比利，希望比利能銷毀書，博士通過機器人梅得知后，把此事告訴了納迪爾議員，以期望能從納迪爾議員處尋到保護。

在外休假的薩姆和比利突然遭到了襲擊，他們盡力反抗，但是比利還是被納迪爾議員的人帶走了。薩姆根據線索找到了海邊，但是依舊沒有比利的身影，薩姆盡快聯系了神盾局。

比利和真正的博士被帶到了一艘潛水艇上，博士故意上演苦肉計，希望能打動比利，隨后船長假裝要刺破比利的眼球，博士看不下去，他只是想拿到《黑暗之書》，并不想真的傷害神盾局特工。

菲茲和邁克他們不斷逼問機器人博士，但是機器人博士對真正博士的下落毫無頭緒。菲茲想要進入機器人博士的編程，結果卻發現編程比艾達那時候高級了很多，菲茲一時攻破不了。機器人博士用菲茲父親和博士的曾經打擊菲茲，菲茲不能面對，他撥掉了機器人博士的電源，原來菲茲父親總是否定菲茲，并在菲茲十歲的時候拋棄了他然后下落不明。

黛西通過面部識別得知襲擊局長的俄羅斯人和這次綁走比利的俄羅斯人都屬于同一特種部隊分部，因為俄羅斯首相曾經被異人攻擊，所以俄羅斯人和納迪爾議員聯合起來，而《黑暗之書》有除掉異人族的辦法，機器人梅趁機詢問薩姆書的下落，薩姆只是說書很安全。

博士通過比利的記憶查看《黑暗之書》的下落，發現比利把書給了薩姆，但是薩姆告訴大家，他把書給了第一個凱尼格家族的特工LT，因為所有凱尼格特工的長相都是一模一樣的，菲爾擔心所有凱尼格特工的危險，他帶領大家緊急保護LT。

LT和瑟斯頓在一個酒吧里，但是瑟斯頓和其他凱尼格特工不一樣，他只是想過簡單平凡的生活，因此對神盾局的到來很不爽。

這時，黛西查到了那些俄羅斯人受聘于安東.艾文諾夫，此人就是潛水艇上的船長。結果LT卻說他們采取了“燙手山芋”活動，最終《黑暗之書》又回到了比利手上，比利把書放在了神盾局的迷宮密室樂山公共圖書館中，只有凱尼格特工家族知道迷宮的存在，另一邊，博士通過比利的記憶也得知了這一切。

菲茲因為被父親拋棄，被沃德背叛，現在又被博士利用，他很難過，西蒙斯為此去安慰他，菲茲從西蒙斯的話中獲得靈感，他明白自己為什么破解不了機器人博士的代碼，因為機器人博士的驅動來自大腦，而不是代碼。菲茲檢測機器人博士的大腦，他和西蒙斯想起博士曾經測繪過一個梅的大腦，他們和邁克明白原來梅才是那個機器人內鬼。

菲茲和機器人梅在等待薩姆取《黑暗之書》的時候，兩個人之間的感情終于捅破了最后一層紙，菲茲和機器人梅接吻了。這時，LT說有三個全副武裝的人帶著比利過來了，薩姆把書給了機器人梅，機器人梅在程序的驅動下把槍對準了菲爾，黛西收到西蒙斯和菲茲的通知，趕了過來用波震制服了機器人梅。

菲爾和黛西救出了比利，比利帶著《黑暗之書》離開，受傷的機器人梅利用比利的善意打暈了比利拿到書，隨后躲在暗處的博士把書帶走了，但是他拋棄了受傷的機器人梅。

神盾局銷毀了艾達和博士的機器人，但是因為沒有找到梅，他們還是保存機器人梅的完好，希望早日找到真正的梅。

因為拿到了《黑暗之書》，博士和艾文諾夫喝酒慶祝，原來艾文諾夫注意到了本應死去的菲爾現在卻無處不在，他認為菲爾是異人族的起源，他期望得到菲爾的下落并殺了菲爾，所以才和博士合作拿到《黑暗之書》。