殺了鄺放(張暘 飾)之后，薛云燼(陳翔 飾)將段思琦和小魚從地牢里放了出來，不過對此，段思琦沒有任何的感激，當知道鄺放畏罪自殺的消息后，段思琦和小魚十分的震驚。馬惠龍(張光北 飾)沒有打通電話便趕來了特訓營，但為時已晚，鄺放已死，馬惠龍只好作罷。不過從鄺放死亡的現場，他發現自己給他打電話之時鄺放應該還沒死，為何薛云燼不接電話，這讓馬惠龍再次對薛云燼起了疑心。段思琦并不相信鄺放是自殺，她覺得鄺放之死應該是薛云燼所為，雖然薛云燼再一次救了她，可是她的心里卻高興不起來。從特訓營畢業，小魚和段思琦也即將分離，小魚想要拉攏段思琦繼續一起并肩作戰，但是被段思琦拒絕了，因為她的心里還想著報仇。在畢業的舞會上，薛云燼邀請段思琦跳舞，但是被段思琦給拒絕了。此時的曾玖雅(韓燁 飾)已經得知了畢業考核的第一名要去日本內部潛伏，心中悔恨不已，她把這種怨恨再次強加在了段思琦身上，她認為都是因為段思琦，自己才會落到現在這步田地。薛云燼找到段思琦，將全部的真相告訴給了她。一直以來的隱瞞，除了不想被馬惠龍看出破綻外，薛云燼更多的是想要保護段思琦，不想讓她陷入更深的危險。可是段思琦無法原諒薛云燼，特別是因為他泄露了自己用生命守衛的那兩句父親的遺言。盡快薛云燼做出解釋，可是段思琦無法理解，因為那兩句段平山(申軍誼 飾)用生命捍衛的遺言對她來說非常重要，而薛云燼的做法讓段平山的死毫無價值，因此段思琦開始恨薛云燼了。特訓營結束，楊二(杜冠儒 飾)仍然繼續盯住段思琦，他認為馬惠龍一定不會讓段思琦離開武城的。此外，最近的行動頻頻受阻，楊二猜測是新密碼本泄露所致。為了驗證這個猜測，楊二想出了一個非常歹毒的辦法。他猜測是共產黨竊取了他們的密碼本，于是把之前發現的共產黨的秘密電臺故意透漏給國民黨，讓改名為復興社的密查組幫自己調查密碼本是否泄露。畢業之后，小魚回到了藥堂，她現在被分派去了復興社機要科負責情報分析，因此回藥堂的一路上非常謹慎和小心。蔡明志(郭秋成 飾)見到小魚非常告訴，他拿出一張照片，是想要投入黨組織的同志，曾經在特訓營待過，于是讓小魚甄別身份。小魚拿過照片一看，竟然是小不點。此時段思琦正式接下了去康司令(杜功海 飾)府臥底的任務，薛云燼是她的聯絡人，可是段思琦對他十分冷漠，由此可見段思琦對薛云燼的誤解很深。小魚將小不點的事情告訴給了段思琦，這個時候段思琦才意識到自己誤解了薛云燼，薛云燼并非表面的那樣冷血，他所做的一切都是為了保護自己。此時的段思琦有些后悔了。上海淪陷，武城也鬧起了饑荒，社會動蕩，民不聊生。而段思琦也開始了接近康少霆(康磊 飾)的行動，大壯和一名男組員裝作兄妹在大街上演了一場戲，哥哥要拿走家里所有人的錢去抽大煙，還痛打妹妹。康少霆經過此地，年輕熱血富有正義的他毫不猶豫的站出來伸張正義。而借此機會，段思琦出場了，一直苦苦尋找她的康少霆當然非常高興，拉著段思琦侃侃而談。薛云燼見二人聊得起勁，便下令讓她撤退，可是段思琦不聽，這可把薛云燼給氣壞了。康少霆一怒之下砸了面前的這家煙館，然后帶著段思琦離開了。這一次段思琦告訴了康少霆自己的化名，她成功的接觸上了康少霆。