傾心于天文研究的兜甲兒自美國NASA留學歸國，來到宇門源藏博士創辦的宇宙科學研究所見習協助研究，并藉此結識了茂才特立的所長養子宇門大介。伴隨著曾出不窮的不明飛行物體出現，月亮在夜晚中產生被染成紅色的異象，處心積慮企圖征服全宇宙的‘貝加星聯合軍’（ベガ星連合軍），將魔爪伸往地球再掀新的戰端，以月球背面作為據點舉軍率領大量飛碟及‘飛碟獸’（円盤獸）、‘貝加獸’（ベガ獸） 進行侵略戰爭。有著一段不為人知的慘痛過去的弗利特星王子宇門大介，為了不讓所熱愛的第二故鄉重蹈覆轍，毅然地再度挺身而出駕駛古蘭戴薩（グレンダイザー），恢復“杜克?弗利特”（デューク?フリード）之名誓死賭上自身性命，與甲兒一同保護這片綠意盎然的大地。

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