闖王大軍入城。曹化淳開彰義門，帶領三百多名太監恭迎闖王。袁承志(竇智孔 飾)安排各路人馬接應闖王。天下大事初定。袁承志自己只身再次入宮刺殺崇禎(高虎 飾)，不想宮內遍尋崇禎與阿九(孫菲菲 飾)不獲。抓住個下太監一問，原來崇禎竟然逃出宮去了，袁承志急忙去追。崇禎換上普通人衣帽，帶著一些持兵器的武閹在四城亂撞，卻無法找到一條求生之路，于是遣散宦官，自己只身又回到了宮中，他再次敲響了景陽宮的大鐘，卻沒有一個官員前來報到。

袁承志沒有找到崇禎，惦念阿九，又回到宮中。此時的崇禎已經瘋狂，周皇后上吊，崇禎連連叫好，隨即又親手砍殺了幾個嬪妃，而趕來的女兒阿九不愿離開宮時，崇禎猜到阿九是在等袁承志，崇禎騙過金蛇劍，一劍砍斷了阿九的左臂。袁承志于此時趕到，救下阿九，他出手要殺崇禎，崇禎閉目待死，阿九大叫了一聲“不要!”但是袁承志卻在此時理解了崇禎的悲哀心境，因為這個人已經死了，他做了十七年的皇帝，卻沒有過過一天快樂的日子。

崇禎此時但求一死，他告訴袁承志，自己殺袁崇煥的時候只有十九歲，比袁承志現在還小，他要做中興之主，卻成了亡國之君，自己沒有面目去見列祖列宗，袁承志卻說，也許你的列祖列宗沒臉見你。于是，袁承志放過崇禎，他抱了阿九，走出宮去。此時四野寂寂，袁承志心中百感交集，望著懷中的斷臂的阿九，只想大哭一場!崇禎與太監王承恩自縊于煤山……回到正條子胡同。此時的山宗舊部看到斷臂的阿九，聯想到她國破家亡的身世，不免對阿九有了難得的寬容。但是青青看到袁承志抱回阿九，反應十分強烈……因為袁承志不但沒有殺崇禎，且還將阿九帶了回來!雖說阿九身世堪憐，得到了大家的同情，青青不得不忍下心中不快，但袁承志忙于大事，也忽略了對青青的關心。闖王登基，封袁承志為三品果毅將軍。論功行賞。封崇禎太子為宋王。

與此同時，袁承志和李巖(程皓楓 飾)兩人在北京街頭見到許多百姓遭到闖軍的劫掠，許多是劉宗敏的部下，但是這些人仗著劉宗敏的權勢，根本不把二人放在眼里，袁承志勃然大怒，出手懲戒，這才讓這些人有所收斂，只是人數太多，讓李巖、袁承志二人抓不勝抓，只能是浩然長嘆。不但闖王的軍隊并不是想象中的王者之師，等真正見到權將軍劉宗敏時更是生了大麻煩，劉宗敏先不滿足于只分到了幾名宮女，而袁承志卻擁有了美麗的阿九公主，加之袁承志懲治了他的部下，更是惱火，于是非要搶奪阿九。他本以為只要一聲令下，袁承志小小的果毅將軍還不馬上獻上公主，不想袁承志根本不買賬。劉宗敏惱羞成怒，于是派兵去搶。袁承志雖然人馬少，但是個個武功高強，劉宗敏無法得逞，雙方僵持不下。

最終經過李巖的努力，還是闖王出面，才暫時平息了二人的爭斗。山宗舊部如孫仲壽等人懇請闖王，此時還不是慶功的時候，關外的滿清仍在虎視眈眈，不可掉以輕心，但此時的闖王已經過度膨脹，完全聽不進去，反而將眾人斥退。孫仲壽連連嘆息…其實這是上梁不正下梁歪，李巖和袁承志就曾聽說闖王自己搶了吳三桂的愛妾陳圓圓，劉宗敏有此舉也不奇怪。阿九之事雖然平息，但是袁承志的后院卻起火了，青青認為袁承志此舉完全是為了阿九與劉宗敏爭風吃醋甚至是大打出手，和袁承志大吵了一架。

而此時的袁承志，已經悲哀地發現闖軍變質了，其軍紀似乎比明軍好不到哪里……心情郁悶之下，反而斥責了青青在國家劇變的時候居然還為這等兒女情長的小事煩他，青青從來沒見過袁承志這樣疾言厲色地對待自己，更認為袁承志是為阿九才如此，大哭而去……但是袁承志已經無法去安撫青青了，他和李巖跑到皇宮門前求見闖王，希望闖王能夠整肅軍紀。但是闖王卻在元龍高臥，根本不見。袁承志和李巖在宮外足足等了一夜，最終還是無奈而返。難道改朝換代之后換來的就是這些嗎?兩人在巷子口遇到了一個唱曲的盲人，他唱的曲子竟一直在袁承志心頭回蕩——昨日的萬里長城，今日的一縷英魂…