諾亞計劃實施，所有空境都被禁止，杰米正通知米奇他們之時，門薩就帶人前來，將米奇他們全都抓了回去。關進山洞之后，米奇他們發現了躲在山洞縫隙里的洛根，這才知道牧羊人會將他們制造出來的怪物放進山洞喂食，他是因為躲進了縫隙才保住自己一命。剛把事情告訴米奇他們之后，喂食的信號又響起了，米奇他們只能趁門開了之后，馬上從山洞里逃跑，救自己一命。從山洞里逃出來之后，米奇他們被牧羊人基地的保安發現了，而此時那些怪物也跑來了，米奇他們便趁著怪物襲擊牧羊人之時，跑回了自己的飛機之上。安全躲回飛機之后，米奇馬上聯系奧德拉，這才知道奧德拉和賈斯汀都死了，而克萊曼婷不知所蹤。洛根在亞伯拉罕他們看新聞之時，說明他有辦法找到克萊曼婷，讓他們給自己一部手機聯系軍方的人，讓他可以彌補之前的錯。因為飛機上的東西都被牧羊人帶走了，杰克遜和米奇、杰米一起到牧羊人基地找資料，結果發現皮爾斯已經知道他的X光影影響到了動物，所以他將三螺旋動物都進行了絕育。米奇認為皮爾斯并沒有讓三螺旋滅絕，而是讓它在動物體內休眠，直到遇上母細胞之后被喚醒，才讓一百多年前的事情再重演。拿到想要的基化石血清之時，雜交狼已經在開始咬柵欄了，而還有一部分狼已經朝控制中心來了，米奇只能謊稱他控制了柵欄，讓杰克遜和杰米先拿著血清和牧羊人的資料離開，他留在控制中心想辦法讓所有隊員可以成功離開。杰克遜回到飛機之時，米奇聯系了亞伯拉罕，讓他們照顧克萊曼婷，而他則在雜交狼闖進來之前，啟動了柵欄電源處理掉飛機附近的的那些狼，讓飛機及時起飛，而他則成為控制中心的那些狼的晚餐。杰米得知亞伯拉罕把米奇留下，她馬上通知機長調頭，亞伯拉罕只能讓飛機繼續航行，然后告訴杰米，米奇已死的消息，說明他們要去緬因找到克萊曼婷，完成米奇的最后遺愿。杰克遜和杰米去見克萊曼婷之時，不敢把米奇的事情告訴她，只能將米奇用命換來的血清給克萊曼婷，可克萊曼婷卻因為米奇沒有實現諾言治好動物，而怨恨米奇。找到克萊曼婷后，那里的人都因為動物的迫害，想要殺了那些寵物，讓被關押的寵物狗都受到了驚嚇。杰克遜看到了那些被釋放的帶解藥的鳥，可并沒有看到動物恢復正常，亞伯拉罕只能親自去接近其中一只狗，確定它們是否被治愈。得知解藥有用之后，所有的寵物狗都被釋放了，克萊曼婷也見到了自己的那只狗，她開心地表揚米奇做到了他的承諾，急著想見米奇，這才知道米奇因此犧牲了。所有的動物被治愈，而國際動物防御組織卻成了最大的領功者，讓所有人認為是他們的毒氣救了那些動物。杰克遜打開了羅伯特的郵箱，找到了羅伯特給戴維斯的毒氣方程式，而他也意外發現那個毒氣方程式和皮爾斯筆記上的一樣，是給動物絕育的方程式，現在毒氣的釋放讓全人類都失去了生育功能。幾年后，因為人類失去了生育能力，很多學校都因為沒有新生而被迫關閉，而混種動物的襲擊問題也愈演愈烈。亞伯拉罕帶著達瑞拉和兒子艾薩克，正準備離開學校之時，一個女人前來找亞伯拉罕，告訴他有關米奇以及牧羊人的事情，讓亞伯拉罕跟她去見米奇。亞伯拉罕不相信女人所說的話，女人只好告訴亞伯拉罕，自己就是米奇的女兒克萊曼婷，而現在只有她知道米奇在哪里。（本季終）