杜正宇看著賢秀手機上吳景民的號碼，決定調查賢秀的手機定位，看他去過什么地方，因為他知道吳景民是吳正煥(金太祐 飾)的兒子，而吳景民的朋友又是預告殺人案的死者金俊英的朋友，他懷疑殺害賢秀的就是吳景民，他也可以以此接觸吳正煥。白夜村附近雨停了。杰米早起不見李志旭，趕到碼頭發現他播報，兩個人上船直奔白夜村島嶼而去。地下藥廠老頭發現賢秀在一個叫延實洞的地方停留了一個小時左右。杜正宇來到那里，看到有監控設備。張志苑、尹碩弼(崔大哲 飾)在辦公室百無聊賴，卻突然接到杜正宇電話，要他用電腦查自己所在的監控視頻。杜正宇還要求不要把這事告訴孔慧媛，張志苑卻告訴他，孔慧媛辭職了。孔慧媛在家里內心糾結。她父親孔一道卻還在實驗室里拿孩子做實驗，和曹賢熙一起嘆息現在連實驗體都不好找了。提起破壞這一切的杜正宇，曹賢熙說杜正宇的名字都是她給起的。張志苑發現監控之前十天的視頻都被刪除了。這時杜正宇在電視上看到了李志旭在碼頭發出的那個新殺人預告的報道，也看到了杰米和他在一起。張志苑和尹碩弼也在辦公室研究新的殺人預告，全無頭緒。他倆正說著杜正宇剛才來電話的事，卻不想被進門的孔慧媛聽到，她是看了李志旭的報道，又匆匆趕來特搜隊的。雖然杜正宇不讓把事情告訴孔慧媛，可張志苑和尹碩弼在孔慧媛的追問下，最終還是吐露實情。孔慧媛他們開始按照杜正宇教的辦法，破解預告上的殺人密碼，杜正宇那邊也在破解。孔慧媛他們得出結論，預告說的是，明天凌晨一點三十分，有人在延實洞上吊。杜正宇也解開密碼，看到死亡地點正是賢秀死的延實洞，眼前一亮。吳正煥正聽自己那位一號打手匯報，孩子們的尸體都已經處理好了，并對他謊稱杜正宇還沒消息。杜正宇又來到延實洞，發現一輛落滿塵土，許久未使用的汽車，發現車上的行車記錄儀還在工作。他立刻看著記錄儀上的號碼，打了一個電話，然后不知從哪里搞到了記錄儀的視頻，看到賢秀死的那晚，吳正煥的一號打手帶人進入這里的一條巷子，又把一個沉重的大袋子搬出來，袋子很像是裝了一個人。杜正宇明白了，很可能是吳景民殺了賢秀，吳正煥不得不為兒子善后。他還判斷，兇手選擇延實洞這里，很可能是要殺吳景民。兇手文在雄也在李志旭的報道影像里看到了杰米，他隨即離開住處，而張龍植又趕緊向孫旻虎報告，告知文在雄將利用吳景民，讓杜正宇掉進陷阱。孫旻虎正高興可以把這兩個人一網打盡，忽然也看到了李志旭報道視頻里的杰米，然后陰險地笑著說，是一石三鳥。杜正宇試著用賢秀手機打電話給吳景民，但吳景民正處在文在雄的催眠狀態嗨著呢，倒是文在雄注意到他的手機在響。吳景民在夢中再次殺死賢秀，然后看著手腕上的時間，按時間準備上吊，卻就在這時候醒了。文在雄告訴他，就這樣不斷反復刺激大腦，恐懼就會慢慢淡化，不好的記憶就會慢慢被遺忘。他拿出一個藥瓶，讓吳景民今晚吃它，說這樣再入夢就不需要他在身邊，吳景民一個人就可以完成了。杰米和李志旭來到白夜村的島上，這里已經一片廢棄荒涼。杰米在主建筑外的臺階上想起當年那晚，自己看著人們在自相殘殺，嚇得大叫，杜正宇過來抱住了她。走進主建筑，杰米又在樓上一個大房間想起，那個夜晚，杜正宇和她以及另外一個孩子在這里做著什么。孫旻虎來見吳正煥，讓他看杰米和李志旭在碼頭的影像，說他們現在就在沒有別人的白夜村廢墟。意思很明顯，要借機殺人滅口。吳正煥終于用手機，給逃匿的警察廳網絡部門的姜潤城發出指令。白夜村那邊，杰米在操場上又想起杜正宇那時發現同伴暈倒流鼻血，以及他倆和第三個孩子一起演算公式。天黑了，杰米和李志旭準備先離開島嶼，卻發現載他們過來的船已經離開了，手機也沒有信號。兩個人只好回到村里。吳景民吃下了文在雄給的藥。吳正煥從辦公室打電話回來，要妻子和吳景民不要出門。但吳景民還是神情恍惚地出門去了。文在雄開始行動，穿過計算機房，走到街上。監視他的張龍植急忙報告孫旻虎，孫旻虎那邊帶人上車。而杜正宇也駕車在路上奔馳。吳景民來到延實洞，在殺死賢秀的樓頂，繼續在幻覺里殺死賢秀，然后走到真實懸掛的吊索繩套前，看手表的時間已到，笑著主動把頭伸進繩套，剛把自己吊起來，繩子就被人割斷。那人剛救下吳景民，孫旻虎就帶人出現了，他認為前面的背對著自己的那人是杜正宇，讓手下沖過去擒住此人，自己持刀要殺杜正宇，然而那人回過頭來，卻是張志苑。這時孔慧媛和尹碩弼持槍出現，孫旻虎依仗人多，要手下和孔慧媛他們搏斗，但還是被孔慧媛他們擊敗。張志苑背起吳景民，和孔慧媛、尹碩弼離開樓頂。到了樓下，藥廠老頭開車來接應他們，這是杜正宇安排的。孫旻虎只能打電話給張龍植，問文在雄為什么還沒出現？現在不僅文在雄沒出現，杜正宇也沒來，反倒來了一幫警察劫走了吳景民。張龍植聽了也一臉懵。孔慧媛他們的車行在半路，尹碩弼接到黃炳哲(金元海 飾)電話，孔慧媛讓他和張志苑一起回警察廳，自己跟藥廠老頭走。姜潤城帶著吳正煥的打手上了白夜村島，李志旭這時告訴杰米，有了新的殺人預告。杰米看了預告書，也解開密碼，卻發現死亡時間已過。孔慧媛、吳景民跟老頭回到地下藥廠，跟路上的杜正宇聯系。杜正宇告訴孔慧媛，殺人者企圖拖自己下水，而同時兇手要對另一個人下手。這個人自然是杰米。她和李志旭遭遇突襲，李志旭被打昏，她則又被麻醉藥迷昏。張志苑和尹碩弼回到特搜隊，他們議論孫旻虎的話語又被黃炳哲和女部長聽到，他們百般搪塞，終于把黃炳哲和女部長弄走了。回到家的吳正煥感覺疼痛，脖頸上出現傷痕，他拿出一個藥瓶服藥，疼痛很快平復，傷痕也消失了。然后他和妻子卻發現兒子吳景民不見了。妻子要打電話報警，吳正煥卻搶過了她的手機制止。孔慧媛在地下藥廠發現一個眼鏡盒，記起當初在心理診所的現場，杜正宇拿走了一個一模一樣的眼鏡盒。她打開盒子，拿出里面的眼鏡，戴上之后才發現這是一副智能眼鏡，眼前浮現各種白夜財團的數據資料，其中包括父親孔一道，還竟然有張志苑，而且張志苑還是李秉善的私生子。自己的資料也在其中，她這才明白杜正宇當初為什么執意要讓自己進特搜隊。抓到了杰米的姜潤城想向吳正煥報告，卻發現手機沒信號。被捆綁的杰米和李志旭醒來，兩人在試圖弄斷綁繩，而外面的姜潤城卻也遭人偷襲，脖頸上被扎了針劑，癱倒下去。他的手下也早被放倒，做這些的就是文在雄，他走到杰米和李志旭面前，毆打他們，卻又讓杰米記起當年那夜的景象，想起文在雄就是小時候的伙伴。文在雄將著自己小時候的痛楚，說他現在做的只是讓那些作惡者遭受痛苦。他還講起那夜自己和杜正宇、杰米一起逃出白夜村，杜正宇杰米先坐船過河，卻不再回來接他，而是自己上岸逃走了，留下他在島上大聲哭喊不要走。文在雄決心報復，他強行給杰米喂下他給吳景民的那種藥片，讓杰米進入夢幻狀態。杰米的眼前出現了當年在白夜村，杜正宇和她以及文在雄在那個大房間的景象，他們那時只是在煮東西吃。而到了那個殺人的夜晚，杜正宇他們三個也躲在大房間里。杜正宇一個人先出去看動靜，杰米和文在雄隨后也出去。然后他們就看到故事開頭那一幕，一個大人抱著杜正宇哭泣。文在雄就是想讓杰米在死前找回過去的記憶，并為此而痛苦。他說你們給我的痛苦，我原樣奉還。說著就持刀走向杰米。這時杜正宇突然出現，對文在雄說，那時候本來是叫你等著的。那個夜晚的杜正宇，在和杰米上船之前，明明告訴文在雄，你別亂跑，在這等著，我馬上回來。文在雄卻只管哭叫你別走，別只留我在這里啊。屋外電閃雷鳴，杜正宇和文在雄即將對決。