程慈航(喬振宇 飾)發現劉阿常(馬侖 飾)手中緊緊拽住一塊玉佛，不明白劉阿常是什么意思，又想跟他說什么。程慈航去了劉阿常家，在佛像后面看到嚴達慶(王品一 飾)在茅山監獄的檔案，安排他去工作的高官是莫采石(巫剛 飾)。程慈航沒想到真的是莫采石，一切如他所預料，如今進退兩難，不知道該怎么辦。程慈航發現家里座鐘根本就不是父親程國棟的遺物，憤怒的砸碎了座鐘，不明白莫采石為何要騙他。　　程慈航和霍蜜兒(郭曉婷 飾)去藏經樓歸還那本經書，大師告知憲兵在阻攔，現在他們也無法進去，說是要委員長的手諭，還有一個什么劍才能進去，霍蜜兒提起之前那個侍從室的花名冊，有個特別行動隊，但始終找不到。通過了解，程慈航明白了，日本受降儀式的第二天，也就是九月十號那天有人從中央博物院取了東西放到了藏經樓，至于為何需要重兵把守，答案就是那個東西是大家一直在找的五九檔案，程慈航一定要進藏金樓看看。　　關天平(司源 飾)請程慈航無論如何要幫他們組織找到五九檔案，要上交到遠東軍事法庭，而他們身后是四萬萬的同胞，知道和程慈航的目標是共同的，程慈航明白關天平那個是什么樣的組織，只不過他是獨立偵探，不想加入任何組織。霍蜜兒去霍然(屈剛 飾)辦公室翻了個底朝天，找到了委員長的手諭。　　侍從室給莫采石送來密函，看完密函的莫采石感慨自己終于等到這一天，不然他要徹底崩潰。霍然跟莫采石抱怨霍蜜兒自從跟程慈航在一起越來越大膽，竟然拿走了委員長的手諭，莫采石安慰霍然別太擔心，那不過是過時的手諭，沒什么用。霍蜜兒將重新弄好的委員長親筆手諭給了程慈航。　　莫采石和哈金斯見面，提出了他要的設備和金額，當然他還有個附加條件，把五九檔案交到哈金斯手中，事成之后要讓程慈航和霍蜜兒去美國生活，因為只有在那才能遠離戰火。程慈航和霍蜜兒燭光晚餐甜蜜浪漫，此時李麗蘭(王偉 飾)卻找來，程慈航曾經答應歐陽倩(安以軒 飾)找到五九檔案后會公布于眾，要跟程慈航一起合作，自打劉阿常死后，聯系了之前發生的一系列案件，程慈航知道五九檔案在莫采石手中，知道該怎么做。